به‌منظور تصویب و اجرای آیین نامه های داخلی و و اجرای مصوبات شورای تحصیلات تکمیلی دانشگاه و نظارت بر امور مربوط به پایان‌نامه‌ها، بخش تحصیلات تکمیلی دانشگاه زیر نظر معاون آموزش و تحصیلات تکمیلی دانشگاه تشکیل شده است. برگزاری جلسات دفاع از پایان نامه های کارشناسی ارشد با هماهنگی دانشکده‌ها، پیگیری پرداخت حق الزحمه داوران پایان نامه‌ها، ارتباط با پژوهشگاه اطلاعات و مدارک علمی جهت ثبت پایان نامه‌های فارغ التحصیلان و دریافت کد رهگیری، بخشی از شرح وظایف این بخش می باشد.